
Le groupe fut fondé en 1990 par trois des membres actuels : Nicklas Barker, Jan Erik Liljeström et Peter Nordins. Sous le nom de King Edward, ils reprenaient essentiellement des morceaux de King Crimson. Anna Sofi Dahlberg les a rejoint en 1991 et le groupe a pris le nom actuel d'Anekdoten.
Leurs deux premiers albums, Vemod et Nucleus, sont majoritairement sombres, utilisant des variations dissonantes et complexes de mellotron, de violoncelle et de basse saturée pour créer une atmosphère post-rock. En 1998, à l'apogée de cette première ère, Nicklas Barker et Peter Nordins s'associent avec Stefan Dimle et Reine Fiske de Landberk pour le projet baptisé Morte Macabre, qui donnera le jour à un unique album, Symphonic Holocaust. Cet album-concept reprend dans leur style personnel des standards des bandes originales de films d'horreur (le thème d'ouverture de Cannibal Holocaust, Lullaby de Rosemary's Baby, etc.), auquel s'ajoute un morceau d'improvisation inédit de 18 minutes.
Depuis From Within, le groupe s'est un peu éloigné du progressif au profit d'un registre plus actuel et accessible, sans pour autant perdre de sa qualité technique, et de son identité sonore.
En concert, Anekdoten a repris des morceaux de King Crimson, Van der Graaf Generator et Magma.